近期，临床与基础医学院（基础医学研究所）本科生在国际期刊《癌症快报》（Cancer Letters）（中科院1区）发表题为“Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma”的研究性论文。临床与基础医学院（基础医学研究所）生物化学与分子生物学系指导老师郭殿豪、2020级临床医学本科生盛楷雯和张琦为共同第一作者，附属肿瘤医院于金明院士及团队成员张竞泽、孙雅雯主任和临床与基础医学院（基础医学研究所）黄淑红教授为共同通讯作者。
食管鳞状细胞癌(ESCC)是我国常见的消化道恶性肿瘤，早期食管癌患者经治疗，5年生存率可达90%，而肿瘤一旦转移，患者生存率仅有3.1%。上皮-间质转化EMT是肿瘤转移的主要途径。但食管癌转移过程中各分期阶段的EMT特征分子并不明确。该研究通过55个全临床病理分期的ESCC单细胞转录组数据鉴定出EMT阳性细胞群体，并确定了87个ESCC 特异EMT相关基因；根据这些特征分子对ESCC患者进行分型，发现高EMT的患者预后差；为改善EMT+患者预后，该研究预测了ESCC EMT靶向药物，并通过实验验证发现达克利司、多西他赛和雷贝马德林等药物可通过抑制ESCC EMT达到降低肿瘤转移的效果。
该项研究中盛楷雯和张琦主要进行生物信息学数据分析工作，两人2021年10月加入郭老师实验室，每周向指导老师汇报本周学习情况与科研进展，熟练掌握了R语言，linux操作系统，scRNA-seq、scATAC-seq和转录组等高通量测序分析技术。依托该项目研究基础，她们在指导老师的帮助下组建本科生团队，获得了第九届全国大学生基础医学创新研究暨实验设计大赛国家级金奖和2023年国家级大学生创新创业训练项目。
全文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0304383524001162
供稿：临床与基础医学院（基础医学研究所） 科研部
